Сначала ставится graphviz, все понятно.
Скачиваем pygraphviz, распаковываем. Если просто запустить из коробки, или с помощью pip install pygraphviz , то получим ошибку что-то вроде Your graphviz installation could not be found.
Поэтому открываем setup.py в пакете и находим строки include_dirs = Nonelibrary_dirs = None В Интернете в разных источниках указывают разные пути, но мне ни один не подошел. Разыскав ...